Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr822-202ENSMUST00000216879 2663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm42440-201ENSMUST00000197906 2284 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Tex47-202ENSMUST00000159546 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm3127-202ENSMUST00000171866 1758 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm15140-201ENSMUST00000112565 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm15312-201ENSMUST00000118827 271 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm15452-201ENSMUST00000119877 240 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm16445-201ENSMUST00000120399 714 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm5646-201ENSMUST00000120568 714 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm15309-201ENSMUST00000121644 240 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm10057-201ENSMUST00000144098 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm16259-201ENSMUST00000145241 553 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm25824-201ENSMUST00000157092 121 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm15914-201ENSMUST00000161922 309 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm25397-201ENSMUST00000176951 92 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 4921511M17Rik-201ENSMUST00000177994 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm15143-201ENSMUST00000178180 714 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm21815-201ENSMUST00000178213 664 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Samt1-201ENSMUST00000178342 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Samt1-202ENSMUST00000178698 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 4921511M17Rik-202ENSMUST00000179369 834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm18728-201ENSMUST00000186155 753 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Il20-202ENSMUST00000188581 465 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm29376-201ENSMUST00000189357 835 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm19585-202ENSMUST00000191539 327 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Igkv15-97-201ENSMUST00000197637 339 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm18867-201ENSMUST00000198022 1179 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm30484-201ENSMUST00000200327 449 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm31698-202ENSMUST00000214385 527 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 RMST_1.1-206ENSMUST00000218255 309 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 AC153840.1-201ENSMUST00000219685 313 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm7887-201ENSMUST00000056948 537 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr969-201ENSMUST00000074566 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Adgrv1-201ENSMUST00000095585 19338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr124-202ENSMUST00000215168 4497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Adam7-201ENSMUST00000022640 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Vmn1r84-205ENSMUST00000228653 2769 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Cul3-202ENSMUST00000164108 2442 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Crisp2-201ENSMUST00000024724 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Cenpj-201ENSMUST00000065302 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm3867-202ENSMUST00000181639 2007 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm6096-201ENSMUST00000105172 456 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Clec1b-202ENSMUST00000112079 455 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Olfr383-ps1-201ENSMUST00000118895 935 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm14785-201ENSMUST00000120185 539 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm11252-201ENSMUST00000120572 939 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm11804-201ENSMUST00000121663 468 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm25291-201ENSMUST00000122795 144 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 4930519F16Rik-202ENSMUST00000127012 685 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm23902-201ENSMUST00000157571 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm23024-201ENSMUST00000158770 292 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm9017-201ENSMUST00000159613 676 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Naa60-211ENSMUST00000176625 876 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 4930519F16Rik-206ENSMUST00000183292 800 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm27957-201ENSMUST00000184054 127 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm28843-201ENSMUST00000189198 678 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm29546-201ENSMUST00000191171 678 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Mirlet7e-201ENSMUST00000196737 93 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm43856-201ENSMUST00000197004 369 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm42924-201ENSMUST00000197261 185 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Ighv1-79-201ENSMUST00000200152 350 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm7838-201ENSMUST00000203221 1189 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 CR974485.1-201ENSMUST00000222408 402 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 AC131747.1-201ENSMUST00000226159 793 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RpainQ9CWY9 AC144798.1-201ENSMUST00000228120 391 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
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