Protein–RNA interactions for Protein: Q99PQ1

Trim12a, Tripartite motif-containing protein 12A, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12aQ99PQ1 Gm8129-201ENSMUST00000118230 213 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm15012-201ENSMUST00000119176 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm12704-201ENSMUST00000119789 464 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm14898-201ENSMUST00000120202 645 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm12884-201ENSMUST00000120371 325 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm14003-201ENSMUST00000130919 313 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm22789-201ENSMUST00000157884 130 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r23-201ENSMUST00000175817 997 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm27611-201ENSMUST00000184690 108 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 1700015G11Rik-204ENSMUST00000190307 255 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm29552-201ENSMUST00000190548 660 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm37961-201ENSMUST00000192729 299 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm36520-201ENSMUST00000200449 400 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm44817-201ENSMUST00000205416 453 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Bc1-ps1-201ENSMUST00000208471 318 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm36247-201ENSMUST00000211834 285 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 AC160972.1-201ENSMUST00000220971 644 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 AC160114.1-201ENSMUST00000221930 365 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 AC154623.1-201ENSMUST00000224348 805 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Fabp2-201ENSMUST00000023820 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Olfr813-201ENSMUST00000064893 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm5185-201ENSMUST00000080271 619 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm23628-201ENSMUST00000082464 173 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 n-R5s85-201ENSMUST00000083453 113 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Olfr725-201ENSMUST00000089844 1110 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Olfr477-201ENSMUST00000091605 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r43-203ENSMUST00000226741 12542 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Cd200r3-208ENSMUST00000164007 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Mlip-205ENSMUST00000183955 3069 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Mybpc1-201ENSMUST00000119185 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm37588-201ENSMUST00000195024 2496 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm9495-201ENSMUST00000200846 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Tsga10-203ENSMUST00000114902 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Olfr102-202ENSMUST00000217590 2783 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 A730046J19Rik-201ENSMUST00000135687 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Olfr145-202ENSMUST00000213688 6691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm14444-201ENSMUST00000109069 919 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm17132-201ENSMUST00000109542 1158 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Olfr1078-ps1-201ENSMUST00000117978 632 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm14991-201ENSMUST00000119913 598 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Mup-ps21-201ENSMUST00000119998 448 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 1700071G01Rik-201ENSMUST00000146728 367 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 4930548K13Rik-201ENSMUST00000154459 561 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Spanxn4-201ENSMUST00000172433 424 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm27568-201ENSMUST00000184220 99 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm6075-201ENSMUST00000186816 486 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm28685-201ENSMUST00000187545 1101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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Trim12aQ99PQ1 1700027A15Rik-205ENSMUST00000191122 332 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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Trim12aQ99PQ1 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Olfr1142-ps1-201ENSMUST00000213624 805 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
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Trim12aQ99PQ1 Gm5649-201ENSMUST00000217918 951 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 AC131720.3-201ENSMUST00000219113 275 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Olfr1496-203ENSMUST00000219412 1067 ntAPPRIS P2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm6988-201ENSMUST00000222676 375 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 AC167669.3-201ENSMUST00000224720 393 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Olfr1496-201ENSMUST00000057390 1067 ntAPPRIS ALT1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm10147-201ENSMUST00000075388 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm24144-201ENSMUST00000082632 111 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Il13ra2-202ENSMUST00000112827 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Olfr969-202ENSMUST00000213266 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Olfr1082-201ENSMUST00000215600 1620 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Cd53-201ENSMUST00000038845 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Olfr655-203ENSMUST00000215538 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Vmn1r-ps73-201ENSMUST00000173130 2120 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Gm45129-201ENSMUST00000208444 2224 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Pde1a-204ENSMUST00000102653 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
Trim12aQ99PQ1 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
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