Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gm17155-201ENSMUST00000165969 473 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm20692-201ENSMUST00000177251 681 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm26991-201ENSMUST00000180950 620 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm18350-201ENSMUST00000187395 955 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm28269-201ENSMUST00000189511 559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Olfr673-ps1-201ENSMUST00000210859 411 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 1700026F02Rik-205ENSMUST00000212266 787 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 CT030657.1-201ENSMUST00000222397 378 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Olfr1151-201ENSMUST00000061081 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Vmn1r234-201ENSMUST00000079633 990 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Zfa-ps-201ENSMUST00000180526 2231 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Chl1-203ENSMUST00000203830 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Zfp280c-203ENSMUST00000088898 4024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Il22ra2-201ENSMUST00000036564 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm6969-201ENSMUST00000140065 342 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm29380-201ENSMUST00000185898 416 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm9931-201ENSMUST00000193584 1185 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm8747-201ENSMUST00000195392 751 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm43308-201ENSMUST00000197236 373 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 AC144783.2-201ENSMUST00000219089 195 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm26861-206ENSMUST00000222633 1039 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 AC166369.1-201ENSMUST00000228126 351 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm14696-201ENSMUST00000144294 3976 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm12010-201ENSMUST00000122400 2017 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm14062-201ENSMUST00000134795 4134 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Lrrc37a-201ENSMUST00000153273 9647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm10033-204ENSMUST00000213012 7778 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Helz-203ENSMUST00000106746 13147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Olfr586-203ENSMUST00000213281 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Sucnr1-201ENSMUST00000029326 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Trbv16-201ENSMUST00000103274 398 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Igkv1-131-201ENSMUST00000103306 362 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Arl6-203ENSMUST00000118438 875 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm12978-201ENSMUST00000121250 522 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm12819-201ENSMUST00000122223 629 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Pfdn4-205ENSMUST00000136839 452 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm17218-201ENSMUST00000165911 410 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm28830-201ENSMUST00000188192 213 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Zfp638-206ENSMUST00000203324 3822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 AC166263.1-201ENSMUST00000218586 238 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm25205-201ENSMUST00000082841 103 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Snora70-201ENSMUST00000083047 137 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Zfp458-204ENSMUST00000225772 3485 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Zfp458-201ENSMUST00000045969 3488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm38073-201ENSMUST00000195141 3665 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm26743-201ENSMUST00000180913 1726 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Nlrp4b-201ENSMUST00000047809 3274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Hrnr-201ENSMUST00000090856 10656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Aak1-202ENSMUST00000089519 19341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Olfr1369-ps1-203ENSMUST00000213922 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Nlrp2-201ENSMUST00000045022 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm15141-201ENSMUST00000121860 729 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm24244-201ENSMUST00000157317 130 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Slfn5os-202ENSMUST00000216469 550 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Olfr638-202ENSMUST00000218325 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm2710-201ENSMUST00000073196 603 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Snord7-201ENSMUST00000083781 97 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Znf41-ps-201ENSMUST00000122051 2413 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Mmp1b-201ENSMUST00000047888 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Gpr34-201ENSMUST00000041708 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Dbpht2-202ENSMUST00000221311 5341 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
PtprtQ99M80 Pnpla8-201ENSMUST00000043082 13507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Carf-201ENSMUST00000027171 2102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Gm44601-201ENSMUST00000206678 2720 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 AC123035.1-201ENSMUST00000213846 2671 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Gm12571-201ENSMUST00000118132 243 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Gm37279-201ENSMUST00000194630 338 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 AC153794.2-201ENSMUST00000222650 550 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Mir133a-2-201ENSMUST00000083526 104 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Skint4-202ENSMUST00000106564 3997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Skint4-204ENSMUST00000106566 3997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 AC122840.2-201ENSMUST00000221030 2659 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Tor1aip1-210ENSMUST00000169241 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 D930036K23Rik-201ENSMUST00000191894 3964 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Nxt2-204ENSMUST00000112916 2532 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Trav16d-dv11-201ENSMUST00000103606 353 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Gm43015-201ENSMUST00000199087 565 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Tas2r142-ps5-201ENSMUST00000204651 929 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 AL669916.5-201ENSMUST00000214874 361 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 AC135377.1-201ENSMUST00000223692 463 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Gm24626-201ENSMUST00000082621 161 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
PtprtQ99M80 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms