Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm28927-201ENSMUST00000191528 272 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Rnu3a-202ENSMUST00000196710 213 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Igkv13-73-1-201ENSMUST00000196767 200 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm44054-201ENSMUST00000203814 372 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm34224-201ENSMUST00000204606 364 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm17811-201ENSMUST00000206193 387 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm5338-201ENSMUST00000209530 639 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm18160-201ENSMUST00000214279 827 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 AC116726.2-201ENSMUST00000217629 986 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Vmn1r236-201ENSMUST00000066998 1121 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr911-ps1-201ENSMUST00000074987 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Rnu3a-201ENSMUST00000083936 214 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Smim4-203ENSMUST00000090205 426 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Wfdc17-201ENSMUST00000092836 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm44109-201ENSMUST00000204514 1954 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr781-202ENSMUST00000204108 1304 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm5346-201ENSMUST00000056023 2326 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Nsa2-201ENSMUST00000073456 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm15592-201ENSMUST00000143135 1707 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr1338-203ENSMUST00000216559 2829 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm9732-202ENSMUST00000163912 1757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Atp7a-201ENSMUST00000055941 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm14409-201ENSMUST00000108963 1050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm11845-201ENSMUST00000117886 327 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm14975-201ENSMUST00000118741 664 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Itpa-ps3-201ENSMUST00000119034 395 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm13932-201ENSMUST00000120873 610 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm6395-201ENSMUST00000167639 691 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm7346-201ENSMUST00000169661 476 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm18181-201ENSMUST00000190670 736 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm29920-201ENSMUST00000206876 754 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm45830-201ENSMUST00000212945 344 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 3830406C13Rik-217ENSMUST00000225773 417 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 AC124569.1-201ENSMUST00000225932 101 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 AC156790.3-201ENSMUST00000226200 254 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 AC137871.2-201ENSMUST00000226482 289 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr904-201ENSMUST00000058153 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm25821-201ENSMUST00000093657 133 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm10719-201ENSMUST00000099047 681 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr1051-201ENSMUST00000099898 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 AC108802.1-201ENSMUST00000219501 3142 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Vmn2r31-201ENSMUST00000075108 3660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm43921-201ENSMUST00000204296 1792 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm43185-201ENSMUST00000197507 2775 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Slc10a2-201ENSMUST00000023835 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr828-202ENSMUST00000215380 1689 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Nlrp4f-204ENSMUST00000221659 3551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm773-201ENSMUST00000101561 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm16400-201ENSMUST00000116523 1029 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm14408-202ENSMUST00000126726 279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm15414-201ENSMUST00000155217 440 ntTSL 3 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Vmn2r-ps80-201ENSMUST00000173697 914 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm23799-201ENSMUST00000175559 120 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps142-201ENSMUST00000175707 852 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 C130060C02Rik-201ENSMUST00000181731 1142 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm18406-201ENSMUST00000185872 669 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 1700074A21Rik-201ENSMUST00000192404 346 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm18414-201ENSMUST00000210858 694 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gnrh1-202ENSMUST00000223929 428 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 AC131085.1-201ENSMUST00000224746 656 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Vmn1r189-203ENSMUST00000228428 3231 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Gm43376-202ENSMUST00000199747 1743 ntTSL 1 (best) BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 5930435M05Rik-201ENSMUST00000207572 3712 ntBASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC5.16□□□□□ -1.58
Apobec3Q99J72 Scn9a-206ENSMUST00000164384 7530 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.16□□□□□ -1.58
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