Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm27457-201ENSMUST00000184771 156 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 2900009J06Rik-201ENSMUST00000185310 498 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm28619-201ENSMUST00000185889 622 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Csn1s2a-202ENSMUST00000196585 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Cycs-ps2-201ENSMUST00000197114 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Igkv13-82-201ENSMUST00000200308 346 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm21112-201ENSMUST00000212224 578 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm7760-201ENSMUST00000212265 578 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm7807-201ENSMUST00000212475 578 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm18487-201ENSMUST00000215826 878 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 AC156639.1-201ENSMUST00000216503 660 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Sult3a2-202ENSMUST00000223295 930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Vmn1r24-202ENSMUST00000228315 891 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr1112-201ENSMUST00000053050 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Csn1s2a-201ENSMUST00000076379 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr1301-201ENSMUST00000080094 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Rpl21-ps4-201ENSMUST00000080237 438 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 n-R5s196-201ENSMUST00000083136 117 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 n-R5s205-201ENSMUST00000083149 125 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm26176-201ENSMUST00000083795 105 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr259-201ENSMUST00000099862 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr1000-201ENSMUST00000099921 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Igip-201ENSMUST00000210490 1417 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 AC131720.1-201ENSMUST00000218629 2132 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Slc5a3-201ENSMUST00000113975 10913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Myo3a-201ENSMUST00000044749 5082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm43059-201ENSMUST00000202437 1388 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Rapgef4-201ENSMUST00000028525 4109 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr459-203ENSMUST00000214976 3770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm12667-201ENSMUST00000118299 1332 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Wdr49-203ENSMUST00000204341 1344 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Hm629797-201ENSMUST00000183645 2398 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 AC129085.3-201ENSMUST00000225686 1705 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Traj11-201ENSMUST00000103730 59 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm10059-201ENSMUST00000131139 171 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 4930503B20Rik-203ENSMUST00000149825 970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm13985-201ENSMUST00000154409 621 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm26373-201ENSMUST00000157833 103 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 4930558K02Rik-202ENSMUST00000162676 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Malat1-203ENSMUST00000173499 485 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm20456-201ENSMUST00000174690 385 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Aste1-207ENSMUST00000176940 1151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm26992-201ENSMUST00000182089 468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm27964-201ENSMUST00000185195 62 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Il19-203ENSMUST00000187410 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr416-ps1-201ENSMUST00000192734 804 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm43619-201ENSMUST00000197267 914 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Csn1s2b-204ENSMUST00000197301 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 4930404A12Rik-201ENSMUST00000199356 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm43659-201ENSMUST00000200894 628 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr1470-ps1-201ENSMUST00000208620 949 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr32-205ENSMUST00000215659 2998 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 AC153526.1-201ENSMUST00000219750 190 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm10037-202ENSMUST00000221266 549 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gstz1-204ENSMUST00000222222 724 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Cenpk-201ENSMUST00000022227 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 AC154576.1-201ENSMUST00000225864 563 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Fabp9-201ENSMUST00000029038 583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Klhl13-201ENSMUST00000035973 2996 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Defb1-201ENSMUST00000051017 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Tas2r106-201ENSMUST00000076756 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Vmn1r229-201ENSMUST00000076759 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Prl3d2-201ENSMUST00000080755 853 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Mir463-201ENSMUST00000093570 75 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr1438-ps1-201ENSMUST00000208398 4761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm38057-201ENSMUST00000195551 3203 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Olfr126-202ENSMUST00000213844 1958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Nfatc3-202ENSMUST00000211991 3712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Akr1c14-202ENSMUST00000118717 3183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm32444-201ENSMUST00000195147 3511 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Pax6os1-202ENSMUST00000149133 1464 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Rps6ka3-204ENSMUST00000112493 3671 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Vmn1r171-204ENSMUST00000226733 2918 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Mir105-201ENSMUST00000104655 80 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm13321-201ENSMUST00000117101 400 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm15058-201ENSMUST00000117689 458 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm14172-201ENSMUST00000118255 644 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm14417-201ENSMUST00000120036 1074 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Hspe1-ps6-201ENSMUST00000120275 283 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm23792-201ENSMUST00000122557 93 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Chrna1os-201ENSMUST00000125413 680 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm22143-201ENSMUST00000157401 203 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm25185-201ENSMUST00000157754 96 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm23023-201ENSMUST00000158767 109 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm16558-201ENSMUST00000163015 532 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Gm10662-201ENSMUST00000168053 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
Usp49Q6P9L4 Vmn1r-ps52-201ENSMUST00000177426 862 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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