Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Mir3058-201ENSMUST00000175126 91 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm24949-201ENSMUST00000183609 215 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Defb19-201ENSMUST00000053180 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm25630-201ENSMUST00000084000 162 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Ccr5-202ENSMUST00000111442 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Olfr988-202ENSMUST00000111597 1702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm37204-201ENSMUST00000192389 3961 ntBASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.25□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Zfp708-201ENSMUST00000109742 2416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Vmn1r66-205ENSMUST00000228622 3304 ntAPPRIS P1 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm10375-201ENSMUST00000100692 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm11408-201ENSMUST00000117889 519 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm15994-201ENSMUST00000118029 402 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm13508-201ENSMUST00000121639 775 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 n-TSaga9-201ENSMUST00000197675 107 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 E330037G11Rik-201ENSMUST00000204295 1086 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm44674-201ENSMUST00000206159 415 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm45157-201ENSMUST00000208729 401 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm35625-202ENSMUST00000211040 266 ntTSL 3 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 AC118733.1-201ENSMUST00000217387 1217 ntBASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Olfr575-203ENSMUST00000216420 3500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Hfm1-201ENSMUST00000112690 5018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Olfr1033-202ENSMUST00000213865 3664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Cbll1-204ENSMUST00000185739 3945 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Olfr298-202ENSMUST00000213223 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.24□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 1700119I11Rik-201ENSMUST00000122270 336 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm45176-201ENSMUST00000207696 4096 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Olfr168-202ENSMUST00000213480 2205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Mgat4e-202ENSMUST00000172898 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm43881-201ENSMUST00000203051 2530 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 2310057J18Rik-202ENSMUST00000140558 1445 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Olfr826-203ENSMUST00000216661 2858 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm20775-201ENSMUST00000100115 1851 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm16005-201ENSMUST00000120515 269 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Snhg5-202ENSMUST00000182232 781 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm6680-201ENSMUST00000192789 950 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Kap-202ENSMUST00000203168 464 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm19596-201ENSMUST00000203685 739 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm39197-201ENSMUST00000212069 457 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 AC154738.2-201ENSMUST00000227403 1110 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Vmn1r231-201ENSMUST00000061278 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Erbin-204ENSMUST00000169083 5435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Fus-202ENSMUST00000079045 2623 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Sbno1-201ENSMUST00000065263 10071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm37930-201ENSMUST00000194308 1886 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm37176-201ENSMUST00000193300 4051 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 1700017N19Rik-206ENSMUST00000190386 1483 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm6760-201ENSMUST00000114682 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm11869-201ENSMUST00000118701 329 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm11233-201ENSMUST00000122357 634 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm27903-201ENSMUST00000175482 126 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 1700054K19Rik-201ENSMUST00000186102 452 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm29554-201ENSMUST00000187922 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 1700042D02Rik-201ENSMUST00000198232 389 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 AC123835.1-201ENSMUST00000214362 670 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Tmsb15a-201ENSMUST00000073674 299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Ccdc18Q640L5 Vmn1r42-203ENSMUST00000227279 4138 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm27592-201ENSMUST00000157729 126 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm22174-201ENSMUST00000175050 125 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm22692-201ENSMUST00000175055 125 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm27634-201ENSMUST00000175060 126 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm26460-201ENSMUST00000175061 126 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm22460-201ENSMUST00000175269 124 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm24365-201ENSMUST00000175384 125 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm44310-201ENSMUST00000175424 126 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm22639-201ENSMUST00000175591 125 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm24979-201ENSMUST00000178626 126 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm27743-201ENSMUST00000185136 126 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm28186-201ENSMUST00000187447 679 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 AC133283.1-201ENSMUST00000228443 859 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm9765-201ENSMUST00000043170 321 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Snord15a-201ENSMUST00000083888 148 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Vmn1r81-201ENSMUST00000086232 921 ntAPPRIS P2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Olfr262-201ENSMUST00000087818 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm2396-202ENSMUST00000188232 3433 ntTSL 5 BASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm14825-201ENSMUST00000113538 701 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm12902-201ENSMUST00000118389 322 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm28660-201ENSMUST00000186496 253 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm36934-201ENSMUST00000192007 306 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Ccdc18Q640L5 Gm37355-201ENSMUST00000193345 606 ntBASIC6.2□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms