Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Gm24160-201ENSMUST00000104594 126 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Sval2-202ENSMUST00000119995 463 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Sval2-201ENSMUST00000014248 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm2020-201ENSMUST00000145242 579 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm22726-201ENSMUST00000158089 179 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Esp1-201ENSMUST00000161110 1049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 AY512915-204ENSMUST00000162315 676 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm8338-201ENSMUST00000163928 363 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Cfap54-204ENSMUST00000164979 945 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm8220-202ENSMUST00000169601 525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm28146-201ENSMUST00000185517 701 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm28574-201ENSMUST00000185757 699 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm28141-201ENSMUST00000186676 342 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm5116-201ENSMUST00000187732 463 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm28397-201ENSMUST00000187970 699 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm29627-201ENSMUST00000187984 463 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm29592-201ENSMUST00000189434 370 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm29366-201ENSMUST00000190481 699 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm43541-201ENSMUST00000197208 581 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm44818-201ENSMUST00000206608 358 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 CT030184.1-201ENSMUST00000222393 416 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Rpl31-ps2-201ENSMUST00000223231 343 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 AC122448.1-201ENSMUST00000226317 772 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Rnase12-202ENSMUST00000227764 673 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm24622-201ENSMUST00000082619 162 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Snord38a-201ENSMUST00000083746 71 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm23795-201ENSMUST00000084006 137 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Rnase12-201ENSMUST00000089798 545 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm26582-201ENSMUST00000181481 3135 ntTSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Tet2-201ENSMUST00000098603 9179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 AC165080.4-201ENSMUST00000213591 9507 ntTSL 5 BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 AC124586.1-201ENSMUST00000221673 2795 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Cavin4-201ENSMUST00000030033 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
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Usp48Q3V0C5 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6.83□□□□□ -1.32
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Usp48Q3V0C5 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.83□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Olfr527-202ENSMUST00000214143 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
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Usp48Q3V0C5 Gm11290-204ENSMUST00000224688 3042 ntBASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Zfp59-202ENSMUST00000205701 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Akap5-201ENSMUST00000095610 6687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Akap5-202ENSMUST00000154078 6685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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Usp48Q3V0C5 Mmp8-201ENSMUST00000018765 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Atr-213ENSMUST00000215311 8102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Psg-ps1-202ENSMUST00000206181 1943 ntTSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.32
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Usp48Q3V0C5 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
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Usp48Q3V0C5 Rbm41-201ENSMUST00000033810 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 AC122355.1-201ENSMUST00000228155 4184 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Ugt8a-203ENSMUST00000198610 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 AC141438.1-201ENSMUST00000216055 3205 ntTSL 2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Dctn4-201ENSMUST00000025505 3738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Snord116l9-201ENSMUST00000101891 94 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Gm26504-201ENSMUST00000102033 94 ntBASIC6.81□□□□□ -1.32
Usp48Q3V0C5 Igkv1-35-201ENSMUST00000103374 359 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.81□□□□□ -1.32
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