Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIX9

Usp39, U4/U6.U5 tri-snRNP-associated protein 2, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp39Q3TIX9 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Tcrg-V3-201ENSMUST00000103559 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm14322-201ENSMUST00000108942 1074 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm12386-201ENSMUST00000117380 688 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm12102-201ENSMUST00000118251 604 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm14883-201ENSMUST00000120179 157 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm14238-201ENSMUST00000120227 323 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Cyp2j7-ps3-201ENSMUST00000121405 206 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm14530-201ENSMUST00000122391 333 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 4933416I08Rik-201ENSMUST00000125315 703 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm15591-201ENSMUST00000138539 627 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 C030037F17Rik-201ENSMUST00000155211 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm26173-201ENSMUST00000158416 136 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm22945-201ENSMUST00000158557 157 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 BC028528-205ENSMUST00000171519 447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm21915-201ENSMUST00000177787 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm8392-201ENSMUST00000185647 835 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm29216-201ENSMUST00000187117 492 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm18117-201ENSMUST00000187720 742 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm29000-207ENSMUST00000190152 1160 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Igkv2-107-201ENSMUST00000196000 313 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Mirlet7f-1-201ENSMUST00000198652 89 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm43276-201ENSMUST00000199712 364 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm29848-201ENSMUST00000203107 295 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm7039-201ENSMUST00000205138 346 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm8319-201ENSMUST00000205708 641 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm45474-201ENSMUST00000209471 408 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm45427-201ENSMUST00000209572 1253 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 AC134334.1-201ENSMUST00000214277 255 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm19181-201ENSMUST00000218891 940 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm18510-201ENSMUST00000219335 1096 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm40392-201ENSMUST00000220656 562 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps99-201ENSMUST00000221276 1203 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 AC122295.1-201ENSMUST00000223476 388 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 CT009713.9-201ENSMUST00000223604 389 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 AC154627.3-201ENSMUST00000228441 334 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Capza3-201ENSMUST00000043797 1222 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr198-201ENSMUST00000064452 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr1148-201ENSMUST00000077580 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm25139-201ENSMUST00000083247 210 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Kncn-201ENSMUST00000097918 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm5141-201ENSMUST00000167516 1743 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr1138-202ENSMUST00000214573 1611 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm19666-201ENSMUST00000198176 1893 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 AC154511.1-201ENSMUST00000222578 1587 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Stau2-213ENSMUST00000159558 3901 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Obox5-201ENSMUST00000098802 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Plch1-209ENSMUST00000161052 1472 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 4932438A13Rik-217ENSMUST00000152564 15541 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Fat1-206ENSMUST00000215588 13938 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Vmn2r89-202ENSMUST00000159734 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm26002-201ENSMUST00000101915 107 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm14401-203ENSMUST00000108970 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Dppa1-202ENSMUST00000109227 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm12245-201ENSMUST00000117266 357 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm16089-201ENSMUST00000117679 336 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm12332-201ENSMUST00000121397 922 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm14766-201ENSMUST00000121689 367 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm12259-201ENSMUST00000138391 328 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm23435-201ENSMUST00000157183 156 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm25383-201ENSMUST00000157810 144 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm22841-201ENSMUST00000158443 62 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm25907-201ENSMUST00000158486 125 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 1700016C15Rik-201ENSMUST00000016106 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm6632-201ENSMUST00000168425 954 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm17086-201ENSMUST00000171346 484 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm3543-202ENSMUST00000179947 231 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm21171-201ENSMUST00000180048 673 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm26731-201ENSMUST00000180683 543 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Rian-211ENSMUST00000182737 699 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm27234-201ENSMUST00000183362 581 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm28976-201ENSMUST00000188070 144 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm38353-201ENSMUST00000192351 617 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm37828-201ENSMUST00000192496 432 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm37353-201ENSMUST00000194497 313 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Obox4-ps32-201ENSMUST00000196512 537 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm45192-201ENSMUST00000206749 283 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Usp39Q3TIX9 CT030182.2-201ENSMUST00000223569 620 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
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