Protein–RNA interactions for Protein: Q03350

Thbs2, Thrombospondin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs2Q03350 Gm17366-201ENSMUST00000167629 187 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm17538-201ENSMUST00000168236 327 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm20415-201ENSMUST00000172877 423 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Vmn1r-ps25-201ENSMUST00000173545 799 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Mir5110-201ENSMUST00000175537 87 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Ap3m1-ps-201ENSMUST00000177652 1258 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm26057-201ENSMUST00000178099 165 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm14527-201ENSMUST00000179300 639 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 2610528A11Rik-201ENSMUST00000179488 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm22307-201ENSMUST00000180019 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Rpl31-ps7-201ENSMUST00000180629 379 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm29093-201ENSMUST00000187366 409 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Ranbp2-ps11-201ENSMUST00000197185 387 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm43559-201ENSMUST00000198755 466 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm2287-202ENSMUST00000199619 1000 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Igkv13-74-1-201ENSMUST00000200611 242 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm5065-202ENSMUST00000207531 807 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Olfr1035-ps1-202ENSMUST00000213364 288 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Olfr962-ps1-201ENSMUST00000217332 442 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm40271-201ENSMUST00000221752 422 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 AC124595.1-201ENSMUST00000221799 646 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 AC154506.1-201ENSMUST00000225178 621 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 AC114572.1-201ENSMUST00000227262 300 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 AC154436.2-201ENSMUST00000227408 208 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 AC139350.4-201ENSMUST00000228483 798 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Olfr486-201ENSMUST00000072035 945 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Vmn1r211-201ENSMUST00000073728 985 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm24460-201ENSMUST00000082731 106 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 AC147639.2-202ENSMUST00000224834 1545 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Ppp1r1c-202ENSMUST00000090760 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Olfr1260-202ENSMUST00000111512 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Zfp583-206ENSMUST00000165705 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Nsd1-201ENSMUST00000099490 12784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Vmn1r57-202ENSMUST00000227798 2409 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Spef2-201ENSMUST00000041840 4247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Ankar-203ENSMUST00000212573 3952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Fat1-201ENSMUST00000098796 14627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm42697-201ENSMUST00000198992 4092 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm42662-201ENSMUST00000202539 1431 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Tubal3-201ENSMUST00000021639 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 6820402A03Rik-201ENSMUST00000194648 2654 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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Thbs2Q03350 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Thbs2Q03350 Mir6375-201ENSMUST00000197176 95 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm31510-202ENSMUST00000206795 239 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 4930505K13Rik-201ENSMUST00000208641 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm6929-201ENSMUST00000210930 468 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 AC159821.1-201ENSMUST00000214934 248 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 AC165164.1-202ENSMUST00000219324 649 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gpx8-201ENSMUST00000022282 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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Thbs2Q03350 AC113031.5-201ENSMUST00000227116 606 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Efcab9-201ENSMUST00000054327 754 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Olfr835-201ENSMUST00000059315 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm10226-201ENSMUST00000072133 255 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Pirb-201ENSMUST00000078451 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Olfr197-201ENSMUST00000080031 926 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm3867-201ENSMUST00000086108 279 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Thbs2Q03350 Gm1604b-201ENSMUST00000089120 357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
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