Protein–RNA interactions for Protein: P20033

Pdgfa, Platelet-derived growth factor subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfaP20033 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm31166-201ENSMUST00000209326 288 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 4930518J21Rik-201ENSMUST00000209557 573 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm45459-201ENSMUST00000209882 442 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm40608-201ENSMUST00000213692 654 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 AC108846.2-201ENSMUST00000214925 731 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 AC135353.1-201ENSMUST00000215330 630 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Tpbpa-202ENSMUST00000225275 642 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 CT025686.1-201ENSMUST00000227592 438 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 AC159979.1-201ENSMUST00000227927 342 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 AC131029.2-202ENSMUST00000228430 496 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 n-R5s180-201ENSMUST00000082770 106 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm23456-201ENSMUST00000083335 137 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Gm23851-201ENSMUST00000083831 103 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
PdgfaP20033 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm4924-203ENSMUST00000210381 3330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Sspn-202ENSMUST00000111701 4512 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Pls3-202ENSMUST00000114057 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Dleu2-202ENSMUST00000180917 3544 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Zscan4c-201ENSMUST00000131379 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Nlrp5-202ENSMUST00000086341 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm15975-201ENSMUST00000122385 1402 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm16513-202ENSMUST00000201663 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Lifr-203ENSMUST00000171588 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Dnm3os-201ENSMUST00000139662 7928 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm15231-201ENSMUST00000119174 447 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Xlr3e-ps-201ENSMUST00000119644 682 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Xlr3d-ps-201ENSMUST00000121687 658 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm15959-201ENSMUST00000121724 368 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm22345-201ENSMUST00000122644 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Scarna10-201ENSMUST00000158992 325 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm15900-201ENSMUST00000161584 342 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Vmn1r-ps64-201ENSMUST00000173746 655 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm18199-201ENSMUST00000173820 835 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Mir3066-201ENSMUST00000175296 83 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Mir3097-201ENSMUST00000175356 67 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm8247-202ENSMUST00000178759 375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm26969-201ENSMUST00000183203 648 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm3428-202ENSMUST00000184555 416 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm19261-201ENSMUST00000189628 539 ntTSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm37757-201ENSMUST00000193072 210 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm38045-201ENSMUST00000193536 199 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm37459-202ENSMUST00000195007 563 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm43975-201ENSMUST00000203023 481 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm44105-201ENSMUST00000204401 308 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm45127-201ENSMUST00000205984 1015 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm19900-201ENSMUST00000207285 576 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm35453-201ENSMUST00000210304 331 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Cx3cl1-205ENSMUST00000211947 377 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 AC157570.3-201ENSMUST00000219281 205 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 AC116589.7-201ENSMUST00000221061 239 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 AC164117.1-201ENSMUST00000221726 239 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm23927-201ENSMUST00000082466 215 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm23096-201ENSMUST00000083447 107 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Olfr203-201ENSMUST00000089305 924 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Nr3c1-204ENSMUST00000115571 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Wrn-202ENSMUST00000033991 6262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Ckap5-202ENSMUST00000099716 6574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Zfhx4-201ENSMUST00000026284 13874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Slc44a1-205ENSMUST00000107651 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm37761-201ENSMUST00000194989 2098 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Olfr1180-202ENSMUST00000216121 2079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Zfp113-201ENSMUST00000049393 6470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Olfr303-204ENSMUST00000215733 3914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm44668-201ENSMUST00000207911 3265 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Olfr1321-202ENSMUST00000215373 4482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Olfr273-202ENSMUST00000107670 4796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Abcc9-204ENSMUST00000111771 7499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm732-201ENSMUST00000101290 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Vmn2r-ps38-201ENSMUST00000173752 2573 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm42507-201ENSMUST00000201187 2555 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm38067-201ENSMUST00000192346 1911 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Olfr799-202ENSMUST00000213820 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Mug2-201ENSMUST00000081777 4579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm2366-201ENSMUST00000180753 3982 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Olfr390-202ENSMUST00000120081 3604 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Nell1os-201ENSMUST00000134584 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm13942-201ENSMUST00000136950 325 ntTSL 3 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm25520-201ENSMUST00000158389 118 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Rab11a-206ENSMUST00000169058 462 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 9230113P08Rik-202ENSMUST00000176153 414 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
PdgfaP20033 Gm21775-201ENSMUST00000178669 540 ntAPPRIS P1 BASIC5.82□□□□□ -1.48
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