Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
P10404 AC153537.1-201ENSMUST00000215530 858 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
P10404 AC160931.2-201ENSMUST00000221445 351 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
P10404 Gm23686-201ENSMUST00000083241 164 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
P10404 Gm6177-201ENSMUST00000085589 465 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
P10404 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
P10404 Gm9930-201ENSMUST00000066742 3151 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
P10404 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
P10404 Pramel6-201ENSMUST00000026956 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
P10404 Gm13212-203ENSMUST00000119718 2498 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
P10404 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
P10404 Olfr1242-202ENSMUST00000111540 2189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
P10404 Slc14a1-201ENSMUST00000091813 3665 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
P10404 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 AC162908.1-201ENSMUST00000219164 4563 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Hmgb1-rs18-201ENSMUST00000117940 627 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm13228-201ENSMUST00000118937 634 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm14732-201ENSMUST00000121372 545 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm15167-201ENSMUST00000121997 187 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm14970-201ENSMUST00000122289 355 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm25325-201ENSMUST00000122559 86 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm14978-201ENSMUST00000129000 304 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm25117-201ENSMUST00000157194 144 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm15898-201ENSMUST00000162213 627 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Vmn1r-ps31-201ENSMUST00000174112 238 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm20530-201ENSMUST00000174261 254 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm25671-201ENSMUST00000178612 105 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm23307-201ENSMUST00000179167 105 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm25286-201ENSMUST00000179790 105 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm8816-201ENSMUST00000182280 1163 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm27004-201ENSMUST00000183300 727 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Obox4-ps39-201ENSMUST00000184306 628 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Mrgprb1-202ENSMUST00000188095 472 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm28098-201ENSMUST00000191361 699 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm412-201ENSMUST00000193360 948 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm44319-201ENSMUST00000196974 93 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm43144-201ENSMUST00000198256 485 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm42825-201ENSMUST00000198883 723 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Igkv11-114-201ENSMUST00000200013 346 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm7181-201ENSMUST00000202197 434 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm43105-201ENSMUST00000202987 459 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm45023-201ENSMUST00000207951 379 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 BC024386-205ENSMUST00000210080 731 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 AC122210.1-201ENSMUST00000217923 675 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 AC159380.1-201ENSMUST00000218096 121 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 CT025616.1-201ENSMUST00000221158 412 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Olfr726-201ENSMUST00000072370 966 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Olfr746-201ENSMUST00000080616 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Snord42a-201ENSMUST00000082606 65 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 n-R5s65-201ENSMUST00000082614 117 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Dleu2-207ENSMUST00000182756 3530 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Ryr3-211ENSMUST00000208290 15468 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Olfr293-202ENSMUST00000214401 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Olfr1242-203ENSMUST00000143935 2406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm8750-201ENSMUST00000173278 1537 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm7709-201ENSMUST00000199391 1858 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Cep112os1-201ENSMUST00000137907 3005 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm16794-201ENSMUST00000180727 2100 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm37773-201ENSMUST00000194141 2120 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Gm13101-201ENSMUST00000105763 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
P10404 Pja2-203ENSMUST00000172733 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 BC048559-202ENSMUST00000215667 3561 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm29084-201ENSMUST00000185587 1452 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Slco1c1-203ENSMUST00000203140 2771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 AC121844.2-201ENSMUST00000219067 2066 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Olfr221-202ENSMUST00000214071 3044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Ereg-201ENSMUST00000031324 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Zzz3-201ENSMUST00000089982 4197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 A630031M04Rik-201ENSMUST00000146587 3568 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm10378-201ENSMUST00000100696 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm22834-201ENSMUST00000102021 79 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Tex48-201ENSMUST00000102861 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Tcrg-V7-201ENSMUST00000103553 368 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Mir466b-8-201ENSMUST00000103883 86 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm24434-201ENSMUST00000104081 132 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm13085-201ENSMUST00000118356 171 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm13082-201ENSMUST00000118877 561 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm14115-201ENSMUST00000119242 482 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm5060-201ENSMUST00000120072 599 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm13578-201ENSMUST00000120849 590 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm14761-201ENSMUST00000121363 262 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm14736-201ENSMUST00000121470 336 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Zfp950-205ENSMUST00000148569 192 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Sox5os4-201ENSMUST00000155562 365 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm26410-201ENSMUST00000157670 261 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Gm23386-201ENSMUST00000158585 144 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 4930518C09Rik-201ENSMUST00000172700 478 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Csnk2b-207ENSMUST00000174024 883 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
P10404 Mir7046-201ENSMUST00000183435 66 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.3 ms