Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm10074-201ENSMUST00000174543 249 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm21244-201ENSMUST00000178447 684 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Cldn34b4-202ENSMUST00000178974 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Mir6410-201ENSMUST00000184204 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm29598-201ENSMUST00000188996 588 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm19086-201ENSMUST00000190772 665 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm36997-201ENSMUST00000195090 707 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Tas2r146-ps1-201ENSMUST00000203065 934 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm4045-201ENSMUST00000204076 310 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm18791-201ENSMUST00000204611 726 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm18672-201ENSMUST00000208035 270 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm44887-201ENSMUST00000208980 178 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm17989-201ENSMUST00000211543 412 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm39363-201ENSMUST00000214251 723 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 CT025680.1-201ENSMUST00000217375 375 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC100590.2-201ENSMUST00000219028 215 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm26072-201ENSMUST00000083135 107 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Mir30e-201ENSMUST00000083475 92 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Mir26a-2-201ENSMUST00000083496 84 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm22350-201ENSMUST00000083924 156 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Mup3-201ENSMUST00000084531 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Krtap31-1-201ENSMUST00000093935 973 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr583-201ENSMUST00000098211 960 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr1150-ps1-201ENSMUST00000121186 3311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC139754.3-201ENSMUST00000220444 1627 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr821-202ENSMUST00000205181 1993 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr1270-206ENSMUST00000217139 4803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Vmn1r14-205ENSMUST00000227884 7542 ntAPPRIS P2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Dock11-202ENSMUST00000115264 1725 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm7233-201ENSMUST00000168619 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm3985-201ENSMUST00000132101 2515 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Mecom-203ENSMUST00000108271 3851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Vmn2r-ps36-201ENSMUST00000172589 2562 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Zscan4f-202ENSMUST00000145237 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Macc1-204ENSMUST00000222058 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm23697-201ENSMUST00000103897 110 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm13268-201ENSMUST00000117485 433 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Eif3s6-ps1-201ENSMUST00000117907 470 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm11923-201ENSMUST00000118135 508 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Klrc2-203ENSMUST00000118401 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm13852-201ENSMUST00000122350 242 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm3160-201ENSMUST00000128343 607 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm25839-201ENSMUST00000158921 103 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 1700031A10Rik-201ENSMUST00000174380 656 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm38393-201ENSMUST00000179360 1199 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm26556-201ENSMUST00000180645 320 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm26962-201ENSMUST00000182545 265 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm26993-201ENSMUST00000182766 789 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Mir7006-201ENSMUST00000183624 69 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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Ccl20O89093 Trbv11-201ENSMUST00000194354 260 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Traj59-202ENSMUST00000197589 62 ntAPPRIS P1 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm43424-201ENSMUST00000200484 253 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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Ccl20O89093 Gm6230-201ENSMUST00000208077 780 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
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Ccl20O89093 Sult1e1-201ENSMUST00000031201 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
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Ccl20O89093 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Defa36-201ENSMUST00000095424 420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm5248-201ENSMUST00000186108 4046 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm36229-201ENSMUST00000218737 1855 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Zfp518a-201ENSMUST00000050092 6840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Zmym2-201ENSMUST00000022511 6974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr1093-203ENSMUST00000219561 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC167420.1-201ENSMUST00000222999 2121 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr1184-202ENSMUST00000216675 3164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC153948.1-201ENSMUST00000219080 3838 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC154677.1-201ENSMUST00000227636 2805 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr392-202ENSMUST00000144724 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 F8-201ENSMUST00000033539 9784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm14929-201ENSMUST00000152079 1850 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Serpinb7-201ENSMUST00000086690 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr787-202ENSMUST00000213329 4958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Zfp708-203ENSMUST00000190566 2406 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm43260-201ENSMUST00000197378 2430 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm34069-201ENSMUST00000214060 2441 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm11534-201ENSMUST00000125956 204 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm15762-201ENSMUST00000126447 333 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm25965-201ENSMUST00000157170 93 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
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