Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Trbv21-201ENSMUST00000103278 290 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Mir879-201ENSMUST00000104703 76 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm16205-201ENSMUST00000117720 1027 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm4342-201ENSMUST00000118982 367 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm13603-201ENSMUST00000119404 83 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm12336-201ENSMUST00000125962 322 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Nr6a1os-202ENSMUST00000151229 525 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm22794-201ENSMUST00000157228 306 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm3221-201ENSMUST00000164869 440 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm20657-201ENSMUST00000177079 515 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 1700010L04Rik-202ENSMUST00000178848 786 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm8669-201ENSMUST00000183839 945 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm27845-201ENSMUST00000184479 114 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm27818-201ENSMUST00000184536 159 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm18667-201ENSMUST00000186523 484 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm28648-201ENSMUST00000190092 343 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm5731-201ENSMUST00000190969 481 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm32391-201ENSMUST00000191839 540 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm28724-202ENSMUST00000194218 295 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm43828-201ENSMUST00000196890 639 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm42927-201ENSMUST00000200624 3841 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Tprkb-208ENSMUST00000200680 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm18602-201ENSMUST00000209794 851 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm45912-201ENSMUST00000210646 543 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm29785-201ENSMUST00000217033 383 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm19256-201ENSMUST00000218550 231 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm9964-201ENSMUST00000068448 728 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Olfr1014-201ENSMUST00000076250 918 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm25260-201ENSMUST00000083053 134 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Vmn1r21-202ENSMUST00000203488 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Mmp12-201ENSMUST00000005950 3607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Olfr916-203ENSMUST00000214093 3685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm15737-201ENSMUST00000113434 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm8297-202ENSMUST00000171964 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Scn1a-204ENSMUST00000112371 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Btbd35f21-201ENSMUST00000105017 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 1700017N19Rik-207ENSMUST00000190708 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm38032-201ENSMUST00000195052 1589 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm37558-201ENSMUST00000193684 2983 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 AC121569.1-201ENSMUST00000221043 3666 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm38010-201ENSMUST00000192592 2784 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Trav8-1-201ENSMUST00000103643 328 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Mir582-201ENSMUST00000103758 81 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm22273-201ENSMUST00000104040 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm25919-201ENSMUST00000104271 132 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Olfr1083-ps-201ENSMUST00000117704 943 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm13172-201ENSMUST00000118685 256 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm11625-201ENSMUST00000119535 296 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm6565-201ENSMUST00000121217 438 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm13738-201ENSMUST00000122437 469 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm24532-201ENSMUST00000157951 286 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm10319-202ENSMUST00000159439 846 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Vmn1r-ps74-201ENSMUST00000173518 570 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Mir5098-201ENSMUST00000175320 82 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm21865-201ENSMUST00000177713 498 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Mir6343-201ENSMUST00000183584 84 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm28643-201ENSMUST00000188811 356 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm28550-201ENSMUST00000189125 618 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm28460-202ENSMUST00000190590 618 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm38180-201ENSMUST00000192381 395 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm10048-201ENSMUST00000194196 372 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm37640-201ENSMUST00000195407 300 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm42666-201ENSMUST00000201954 152 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Olfr442-ps1-201ENSMUST00000204261 316 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm44622-201ENSMUST00000209128 1033 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 AC153957.1-201ENSMUST00000215235 229 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm18904-201ENSMUST00000218756 329 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 AC239878.1-201ENSMUST00000224212 506 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Vmn1r28-203ENSMUST00000228678 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm7257-201ENSMUST00000041537 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm24707-201ENSMUST00000082812 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm25582-201ENSMUST00000083412 110 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm6361-201ENSMUST00000091031 435 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Ube2v2-201ENSMUST00000096234 609 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Zfp85-202ENSMUST00000144183 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Usp46-201ENSMUST00000068058 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Kcnt2-203ENSMUST00000120796 3540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm43648-201ENSMUST00000197775 2485 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 AC112142.1-203ENSMUST00000228670 2472 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Zfp799-201ENSMUST00000179695 5833 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Vmn2r109-201ENSMUST00000167093 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
Prrt4B2RU40 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 136.4 ms