Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Gm37095-201ENSMUST00000195421 205 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm42830-201ENSMUST00000196642 313 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Csn2-204ENSMUST00000196869 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Csn2-208ENSMUST00000198057 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm43005-201ENSMUST00000199015 648 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 2400006E01Rik-203ENSMUST00000199633 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm44234-201ENSMUST00000204246 900 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Bsph1-202ENSMUST00000204715 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm18598-201ENSMUST00000207724 597 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm18462-201ENSMUST00000208112 417 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm39302-201ENSMUST00000215184 636 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC160030.1-201ENSMUST00000218916 506 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC132384.13-201ENSMUST00000219556 1159 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm46190-201ENSMUST00000219650 427 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Ifngas1-201ENSMUST00000220034 1121 ntTSL 2 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm9616-201ENSMUST00000221154 781 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC158523.2-201ENSMUST00000222708 548 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC131068.1-201ENSMUST00000226891 482 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Clca4c-ps-201ENSMUST00000098551 712 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Il1rapl1-203ENSMUST00000113966 9133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr235-204ENSMUST00000214613 2217 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Cnot6l-210ENSMUST00000155901 8564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Macf1-205ENSMUST00000106220 17608 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm43188-201ENSMUST00000200180 2160 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm43594-201ENSMUST00000201153 3442 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr823-202ENSMUST00000213145 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Vmn2r100-201ENSMUST00000166081 2553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Herc2-201ENSMUST00000076226 15250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Rpl23a-201ENSMUST00000102483 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Igkv11-106-201ENSMUST00000103331 346 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm12467-201ENSMUST00000117625 745 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm12230-201ENSMUST00000118301 454 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr336-ps1-201ENSMUST00000120897 940 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm15212-201ENSMUST00000122403 466 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm23789-201ENSMUST00000122536 301 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 4930419G24Rik-201ENSMUST00000125494 1058 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm29094-201ENSMUST00000138109 664 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 C330018D20Rik-202ENSMUST00000139243 726 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Nell1os-203ENSMUST00000152166 410 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm15795-201ENSMUST00000160969 553 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm2966-201ENSMUST00000166052 481 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm17204-201ENSMUST00000167936 478 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm22693-201ENSMUST00000175049 442 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm23638-201ENSMUST00000175073 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm23158-201ENSMUST00000175076 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm22907-201ENSMUST00000175198 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm22625-201ENSMUST00000175382 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm22875-201ENSMUST00000175449 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm25197-201ENSMUST00000175516 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Rab26os-202ENSMUST00000176921 298 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm27857-201ENSMUST00000176930 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm19898-201ENSMUST00000177490 251 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm26268-201ENSMUST00000177685 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm23681-201ENSMUST00000178821 126 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm27834-201ENSMUST00000183427 125 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm27940-201ENSMUST00000184449 98 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Mir6933-201ENSMUST00000184982 81 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm7634-201ENSMUST00000185778 553 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm29640-201ENSMUST00000187972 278 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm37881-201ENSMUST00000193001 421 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm37193-201ENSMUST00000193087 513 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 2900037B21Rik-201ENSMUST00000194352 337 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Mir142-201ENSMUST00000198092 64 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm44061-201ENSMUST00000203962 1195 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 C430039J01Rik-201ENSMUST00000205973 957 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm6657-204ENSMUST00000211288 1091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr151-201ENSMUST00000211893 1128 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC156504.1-201ENSMUST00000214608 157 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC140930.4-201ENSMUST00000220750 150 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 CT009765.2-201ENSMUST00000221331 392 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC154592.1-201ENSMUST00000225784 574 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Snord14e-201ENSMUST00000082857 90 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr1116-201ENSMUST00000090717 924 ntAPPRIS P2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr1221-201ENSMUST00000099795 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr1098-201ENSMUST00000099872 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm38307-201ENSMUST00000195630 1840 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm27162-201ENSMUST00000185169 2478 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Elavl4-202ENSMUST00000102723 4024 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Igf1-202ENSMUST00000095360 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Vmn1r35-202ENSMUST00000227346 1854 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC153881.3-201ENSMUST00000218494 1561 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Klhl13-204ENSMUST00000115317 3216 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Cyp3a25-201ENSMUST00000068317 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 C230031I18Rik-201ENSMUST00000197856 3698 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm22493-201ENSMUST00000104494 132 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm23178-201ENSMUST00000116782 95 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm15426-201ENSMUST00000117823 556 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Cyp2j7-ps2-201ENSMUST00000119189 179 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr1081-ps1-201ENSMUST00000120210 945 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm16053-201ENSMUST00000120511 188 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Usp46os1-201ENSMUST00000129275 508 ntTSL 1 (best) BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Ugt2a2-202ENSMUST00000144144 929 ntTSL 2 BASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm26347-201ENSMUST00000157526 131 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm22519-201ENSMUST00000158270 178 ntBASIC4.79□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.5 ms