Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm18352-201ENSMUST00000189113 902 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Olfr752-ps1-201ENSMUST00000208736 1141 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 AL672194.1-201ENSMUST00000224841 603 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Olfr586-201ENSMUST00000084811 954 ntAPPRIS P2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm42801-201ENSMUST00000202562 2865 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm42520-201ENSMUST00000199642 1502 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Epha7-203ENSMUST00000108191 6615 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm2987-201ENSMUST00000187673 1693 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r6-205ENSMUST00000227631 7805 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Gm45149-201ENSMUST00000206459 2172 ntBASIC4.15□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Olfr963-202ENSMUST00000215649 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 B830012L14Rik-201ENSMUST00000182785 4505 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
Col5a3Q9JLI2 Fign-203ENSMUST00000131615 9734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 B3galt1-202ENSMUST00000112346 4977 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr732-202ENSMUST00000213701 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r6-203ENSMUST00000227131 8330 ntAPPRIS P2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm4788-203ENSMUST00000111989 3187 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm8430-201ENSMUST00000119780 471 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm13335-201ENSMUST00000129994 471 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm13266-201ENSMUST00000141869 579 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm6264-202ENSMUST00000162896 1217 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm17210-201ENSMUST00000169975 391 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm8641-201ENSMUST00000186995 826 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm37571-201ENSMUST00000195048 614 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm45162-201ENSMUST00000209013 618 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm45322-201ENSMUST00000211642 1361 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm26571-203ENSMUST00000221865 555 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm597-201ENSMUST00000059937 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr535-203ENSMUST00000213715 5033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Cxcl15-201ENSMUST00000031322 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm42770-201ENSMUST00000199657 4155 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Cr2-202ENSMUST00000082321 6207 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr1457-203ENSMUST00000214561 1829 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Serpinb3a-201ENSMUST00000027567 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr1356-202ENSMUST00000205100 3023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm45352-201ENSMUST00000210140 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r71-206ENSMUST00000228098 7165 ntAPPRIS P2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm12412-201ENSMUST00000121867 328 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Grip1os2-201ENSMUST00000153898 722 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm25860-201ENSMUST00000158252 126 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm22840-201ENSMUST00000158444 136 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm20693-201ENSMUST00000177431 211 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm27254-201ENSMUST00000183926 517 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 2010005H15Rik-203ENSMUST00000187742 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm42832-201ENSMUST00000196361 745 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr1480-203ENSMUST00000207904 1209 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm34609-201ENSMUST00000219284 789 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 AC142499.1-201ENSMUST00000220036 374 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Lpar6-201ENSMUST00000044405 5400 ntAPPRIS P1 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm42870-201ENSMUST00000199355 3470 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Zfp981-201ENSMUST00000105735 3038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm14806-201ENSMUST00000116606 2110 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Abca12-201ENSMUST00000087268 9137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm43341-201ENSMUST00000200104 1308 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Cylc1-202ENSMUST00000210720 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr355-201ENSMUST00000100147 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm15403-201ENSMUST00000119343 1227 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm8757-201ENSMUST00000119660 372 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Mir1903-201ENSMUST00000122574 80 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 8030453O22Rik-201ENSMUST00000128919 370 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm15949-201ENSMUST00000129485 126 ntTSL 3 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Mir5128-201ENSMUST00000175217 84 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Trbv8-201ENSMUST00000194020 285 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm44118-201ENSMUST00000204665 229 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm35876-201ENSMUST00000205044 459 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm44611-201ENSMUST00000207507 355 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 AC160124.1-201ENSMUST00000215539 519 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 AC122905.1-201ENSMUST00000218181 456 ntTSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Lrrc69-201ENSMUST00000023917 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Lelp1-201ENSMUST00000029535 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm281-201ENSMUST00000144914 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Zfp120-201ENSMUST00000089207 4127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Ccr1-201ENSMUST00000026911 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Olfr599-202ENSMUST00000214329 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Sycp2-201ENSMUST00000081134 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Tfpi-202ENSMUST00000090732 3576 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm4631-202ENSMUST00000121393 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm43319-201ENSMUST00000198036 2270 ntBASIC4.13□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm7853-201ENSMUST00000100708 478 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm13173-201ENSMUST00000151703 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm15344-201ENSMUST00000152600 421 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm23666-201ENSMUST00000158053 116 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm3646-201ENSMUST00000171319 352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm5726-201ENSMUST00000173886 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm8677-201ENSMUST00000174637 924 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm29588-201ENSMUST00000185738 298 ntBASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm42723-202ENSMUST00000200561 1254 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
Col5a3Q9JLI2 Gm44040-201ENSMUST00000203360 545 ntTSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
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