Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 1810065E05Rik-201ENSMUST00000013797 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 Gm24441-201ENSMUST00000157235 281 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm23198-201ENSMUST00000158811 91 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm16563-201ENSMUST00000162673 423 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm20389-201ENSMUST00000174217 1006 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 Gm14419-204ENSMUST00000178182 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Atg4aQ8C9S8 Gm2004-202ENSMUST00000178872 192 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 Gm19200-201ENSMUST00000182579 1001 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 Hmgb1-203ENSMUST00000110505 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
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Atg4aQ8C9S8 Gm28997-201ENSMUST00000188759 429 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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Atg4aQ8C9S8 Obox4-ps4-201ENSMUST00000196934 397 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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