Protein–RNA interactions for Protein: Q3U319

Rnf40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, mousemouse

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf40Q3U319 Yae1d1-201ENSMUST00000099735 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Trav14n-3-201ENSMUST00000103635 280 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm22660-201ENSMUST00000104193 130 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm23834-201ENSMUST00000104436 129 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr26-201ENSMUST00000104874 931 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm11110-201ENSMUST00000112915 1013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Olfr587-ps1-201ENSMUST00000118378 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm13007-201ENSMUST00000121866 365 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 BC064078-201ENSMUST00000122939 570 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm12729-201ENSMUST00000130088 624 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm14228-201ENSMUST00000131908 798 ntTSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm11626-201ENSMUST00000142107 333 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm24409-201ENSMUST00000157881 152 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm3027-201ENSMUST00000167579 451 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm3104-201ENSMUST00000171004 473 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm26400-201ENSMUST00000175012 85 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Ighv2-6-201ENSMUST00000179657 350 ntAPPRIS P1 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm22633-201ENSMUST00000179834 107 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm26537-201ENSMUST00000181474 652 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm27410-201ENSMUST00000183851 115 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm27210-201ENSMUST00000184263 402 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm5261-201ENSMUST00000185860 713 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm29479-201ENSMUST00000190352 455 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm37511-201ENSMUST00000192901 294 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm37760-201ENSMUST00000194726 3841 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 1700013M08Rik-201ENSMUST00000197709 683 ntTSL 3 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm43495-201ENSMUST00000200060 205 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 BC049739-201ENSMUST00000202626 660 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC153566.2-201ENSMUST00000213841 330 ntTSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC159629.1-201ENSMUST00000220698 568 ntTSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC140208.1-201ENSMUST00000226609 285 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 AC125087.1-201ENSMUST00000227552 514 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Gm24046-201ENSMUST00000083111 165 ntBASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Aox3-201ENSMUST00000040999 4606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.34
Rnf40Q3U319 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr51-202ENSMUST00000213415 2819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm29666-201ENSMUST00000189185 8038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Prrc2c-201ENSMUST00000028016 8815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr1359-203ENSMUST00000214435 4425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr101-202ENSMUST00000214376 2989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.65□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm15356-201ENSMUST00000140669 2741 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Akap4-203ENSMUST00000115751 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 4933402E13Rik-202ENSMUST00000178085 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm44925-201ENSMUST00000208879 2110 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr266-202ENSMUST00000213616 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Clec4e-201ENSMUST00000032239 2518 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gip-201ENSMUST00000103156 607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Mir763-201ENSMUST00000103249 120 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm24473-201ENSMUST00000104483 131 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Omt2a-202ENSMUST00000113376 478 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm12242-201ENSMUST00000118824 738 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm13511-201ENSMUST00000121167 363 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm13973-201ENSMUST00000121371 894 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm11263-201ENSMUST00000121853 749 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm12785-201ENSMUST00000122052 172 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
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Rnf40Q3U319 1700066C05Rik-201ENSMUST00000191029 407 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 1700021F02Rik-201ENSMUST00000197576 350 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm22897-201ENSMUST00000197860 128 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm43538-201ENSMUST00000200416 849 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
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Rnf40Q3U319 Gm43262-201ENSMUST00000202970 1219 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm44609-201ENSMUST00000207157 460 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm7780-201ENSMUST00000214787 406 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC102582.1-201ENSMUST00000215376 378 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AC153821.2-201ENSMUST00000220253 468 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm9269-201ENSMUST00000221661 578 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm35190-201ENSMUST00000222335 526 ntTSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 AL662807.1-201ENSMUST00000224183 126 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr1458-201ENSMUST00000076729 906 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm22974-201ENSMUST00000083301 103 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Zfp967-202ENSMUST00000178443 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Zfp969-203ENSMUST00000179061 1458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Pde1a-203ENSMUST00000102652 1646 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Zp3r-203ENSMUST00000142416 1835 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Sorbs2-231ENSMUST00000171337 5651 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Smarca2-203ENSMUST00000112637 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Gm43896-201ENSMUST00000203440 2032 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
Rnf40Q3U319 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
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