Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Olfr1377-203ENSMUST00000216101 1990 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm43658-201ENSMUST00000202348 4176 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm12022-201ENSMUST00000143311 1340 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 4930562D21Rik-201ENSMUST00000123894 1750 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm43829-201ENSMUST00000196191 3802 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm36969-201ENSMUST00000194551 2809 ntBASIC5.21□□□□□ -1.57
Sh3bp1P55194 Gm43736-201ENSMUST00000196377 2281 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm42494-201ENSMUST00000196515 3051 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Rif1-201ENSMUST00000112693 8509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Zfp300-201ENSMUST00000040667 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Tmco2-201ENSMUST00000106268 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm15560-201ENSMUST00000117107 643 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm14771-201ENSMUST00000118249 203 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm15385-201ENSMUST00000118725 667 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm11790-201ENSMUST00000119569 455 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm13341-201ENSMUST00000120780 672 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm16365-204ENSMUST00000143877 779 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 D6Ertd474e-203ENSMUST00000160188 683 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps146-201ENSMUST00000176131 525 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm16378-201ENSMUST00000179168 342 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm25120-201ENSMUST00000180148 79 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Scgb2b16-ps-201ENSMUST00000188720 333 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 1700121L16Rik-201ENSMUST00000189166 561 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm5511-201ENSMUST00000189380 802 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm29038-201ENSMUST00000191543 678 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm37219-201ENSMUST00000192036 926 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm9245-201ENSMUST00000200528 983 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm44988-201ENSMUST00000203835 1161 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gng12-208ENSMUST00000204511 739 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Nasp-ps1-201ENSMUST00000205050 691 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm4501-201ENSMUST00000207330 551 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm4558-201ENSMUST00000207886 521 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm4528-201ENSMUST00000207905 551 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Arl2bp-203ENSMUST00000211858 318 ntTSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 AL929265.1-201ENSMUST00000213427 125 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Fam228b-208ENSMUST00000219898 288 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm7822-201ENSMUST00000222433 581 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 CT010456.2-201ENSMUST00000222665 1053 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 CT025525.4-201ENSMUST00000227728 277 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr811-201ENSMUST00000076437 960 ntAPPRIS P1 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Hsf3-205ENSMUST00000179832 1972 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 5330434G04Rik-202ENSMUST00000136406 3545 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Ctsj-202ENSMUST00000224224 1421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Ptprc-203ENSMUST00000182283 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Mga-203ENSMUST00000110773 13577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr247-202ENSMUST00000215871 1983 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm15304-201ENSMUST00000122150 2640 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Klra2-201ENSMUST00000032306 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 4933403O08Rik-203ENSMUST00000164272 1517 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm25414-201ENSMUST00000101814 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm14995-201ENSMUST00000117135 391 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm12039-201ENSMUST00000118219 180 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm14525-201ENSMUST00000119649 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm11387-201ENSMUST00000120266 772 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm24371-201ENSMUST00000122662 267 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm6486-201ENSMUST00000166202 434 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Vmn1r-ps145-201ENSMUST00000175863 424 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Obox4-ps14-201ENSMUST00000177198 1127 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm24417-201ENSMUST00000178123 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm24653-201ENSMUST00000178541 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm25934-201ENSMUST00000178642 79 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm5798-202ENSMUST00000179987 582 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm21045-201ENSMUST00000183058 1020 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm28957-201ENSMUST00000190174 373 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm29097-201ENSMUST00000190273 422 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 1700031M16Rik-207ENSMUST00000191513 847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm38141-201ENSMUST00000192540 317 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm37213-201ENSMUST00000193077 586 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm43345-201ENSMUST00000199484 269 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm42761-201ENSMUST00000201899 738 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm19617-201ENSMUST00000202977 308 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 AC127581.1-201ENSMUST00000214084 771 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 AC153516.1-201ENSMUST00000217955 779 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 AC117240.2-201ENSMUST00000220921 263 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Selenok-ps6-201ENSMUST00000221812 283 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 AC167977.2-201ENSMUST00000225676 682 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 AC125539.2-201ENSMUST00000228339 753 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Defb10-201ENSMUST00000054162 298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr843-201ENSMUST00000061365 1107 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Olfr39-201ENSMUST00000071725 1098 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Vmn1r214-201ENSMUST00000074252 1227 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Defb35-201ENSMUST00000076786 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 Gm10491-201ENSMUST00000085330 117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
Sh3bp1P55194 9330132A10Rik-201ENSMUST00000059118 3727 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
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