Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Emcn-202ENSMUST00000122064 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Btbd35f24-201ENSMUST00000178080 1941 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Olfr1346-203ENSMUST00000215302 4525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Bbx-201ENSMUST00000066037 4523 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Atf7-210ENSMUST00000184616 7147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm37238-201ENSMUST00000195552 2390 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Serpina9-201ENSMUST00000058464 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm11032-201ENSMUST00000109941 102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm13550-201ENSMUST00000118185 525 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm14359-201ENSMUST00000118883 424 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm12023-201ENSMUST00000145182 520 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm15634-201ENSMUST00000147206 492 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm23280-201ENSMUST00000157905 139 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm24976-201ENSMUST00000158972 135 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm2871-201ENSMUST00000179984 1204 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
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PtpreP49446 Gm19641-201ENSMUST00000188432 417 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm5284-201ENSMUST00000199053 903 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm43067-201ENSMUST00000201580 445 ntTSL 3 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm45146-201ENSMUST00000207108 221 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 1700061N14Rik-201ENSMUST00000212295 463 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm30122-202ENSMUST00000218662 1556 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AC135019.1-201ENSMUST00000219949 307 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm2614-201ENSMUST00000223227 403 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AC154527.1-201ENSMUST00000225809 242 ntBASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Lrrc49-201ENSMUST00000053171 3086 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Rsrc2-219ENSMUST00000182955 1685 ntTSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Sis-201ENSMUST00000094190 5887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Bcap29-202ENSMUST00000177962 6155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Pcdh15-237ENSMUST00000193361 7881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.8□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Timm17a-201ENSMUST00000081104 7280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AC151831.1-201ENSMUST00000227609 4033 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Tlr11-202ENSMUST00000185091 3207 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm43169-201ENSMUST00000199544 4734 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Ccp110-201ENSMUST00000038650 4716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpreP49446 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Fam196b-202ENSMUST00000165963 5371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Atp2b4-202ENSMUST00000112264 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm13088-201ENSMUST00000105771 1819 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm5886-203ENSMUST00000203983 2613 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PtpreP49446 Hikeshi-203ENSMUST00000117354 297 ntTSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm13469-201ENSMUST00000118231 350 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
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PtpreP49446 AC133207.3-201ENSMUST00000217694 464 ntTSL 3 BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PtpreP49446 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm26740-202ENSMUST00000181532 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PtpreP49446 Gm5427-201ENSMUST00000217680 2591 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PtpreP49446 Pde1c-206ENSMUST00000166890 4728 ntTSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
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PtpreP49446 Speer5-ps1-203ENSMUST00000217649 7431 ntTSL 5 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Vmn1r22-203ENSMUST00000228076 3011 ntAPPRIS P1 BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.79□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Gm42541-201ENSMUST00000199871 2249 ntBASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Pcdh15-214ENSMUST00000129404 6857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.78□□□□□ -1.32
PtpreP49446 Olfr722-201ENSMUST00000053290 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.78□□□□□ -1.32
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