Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Gm35371-201ENSMUST00000216204 579 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 AC154816.2-201ENSMUST00000221918 372 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Cldn34c4-201ENSMUST00000052500 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm23677-201ENSMUST00000083156 104 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Olfr806-201ENSMUST00000095245 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Acsm3-202ENSMUST00000106526 2704 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Dnah3-201ENSMUST00000046993 12252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Olfr107-205ENSMUST00000216844 4021 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm10340-201ENSMUST00000170790 1755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Mmp16-201ENSMUST00000029881 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Olfr1297-202ENSMUST00000213398 6998 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Dmd-201ENSMUST00000113991 4438 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 9130208D14Rik-201ENSMUST00000146911 7293 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Vmn1r184-202ENSMUST00000227230 7999 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm26418-201ENSMUST00000104275 137 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Ctps2-203ENSMUST00000112300 741 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm15313-201ENSMUST00000119179 282 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Cyp4b1-ps2-201ENSMUST00000119563 333 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm13687-201ENSMUST00000119857 282 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm6373-201ENSMUST00000121026 360 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm15057-201ENSMUST00000121516 534 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm17216-201ENSMUST00000130872 728 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm25669-201ENSMUST00000157699 112 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm2389-201ENSMUST00000160487 189 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm16094-201ENSMUST00000162784 427 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm4222-201ENSMUST00000165784 470 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm28094-201ENSMUST00000185262 390 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm37300-201ENSMUST00000193327 280 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm36971-201ENSMUST00000195244 378 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm43617-201ENSMUST00000196418 606 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm43930-201ENSMUST00000203868 845 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm17779-201ENSMUST00000213395 394 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Mbd3l1-202ENSMUST00000213625 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 AC117202.1-201ENSMUST00000227007 445 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 AC134577.1-201ENSMUST00000227572 295 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Ly6a-201ENSMUST00000023248 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm17229-201ENSMUST00000097355 1138 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm8744-201ENSMUST00000204475 3581 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Akap6-201ENSMUST00000095737 14847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Agtr1b-202ENSMUST00000163776 1633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm2004-201ENSMUST00000109049 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm14419-202ENSMUST00000126358 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Ankar-201ENSMUST00000053499 4571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm37323-201ENSMUST00000195771 2773 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Vmn1r82-201ENSMUST00000072801 4784 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm44724-201ENSMUST00000207119 5548 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 B130011K05Rik-201ENSMUST00000151765 3270 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Cast-208ENSMUST00000223033 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm32647-201ENSMUST00000206116 3288 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm23175-201ENSMUST00000104371 132 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Olfr596-201ENSMUST00000104880 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm12401-201ENSMUST00000118435 228 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm11398-201ENSMUST00000120330 320 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm12514-202ENSMUST00000150455 699 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm24314-201ENSMUST00000158274 123 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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Hoxd10P28359 Mir6385-201ENSMUST00000184295 105 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
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Hoxd10P28359 Gm34068-201ENSMUST00000193310 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm34732-201ENSMUST00000195441 445 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
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Hoxd10P28359 1700126H18Rik-201ENSMUST00000201903 405 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm43039-201ENSMUST00000202883 963 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm43893-201ENSMUST00000203362 437 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm19039-201ENSMUST00000204363 575 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm3690-201ENSMUST00000211341 262 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 CAAA01216754.6-201ENSMUST00000217183 398 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Olfr790-204ENSMUST00000218901 1070 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 AC139750.2-201ENSMUST00000224424 386 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 AC159231.1-201ENSMUST00000225365 226 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Olfr1093-201ENSMUST00000055273 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Olfr790-201ENSMUST00000056002 1070 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Olfr507-201ENSMUST00000080014 951 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Snord21-201ENSMUST00000082519 94 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Ms4a2-204ENSMUST00000186978 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Olfr782-202ENSMUST00000213970 1944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Olfr1535-202ENSMUST00000217519 3959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm6902-202ENSMUST00000191169 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm43209-201ENSMUST00000198949 1588 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Zfp352-201ENSMUST00000080541 1656 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Peli1-202ENSMUST00000101477 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Cep290-201ENSMUST00000164751 8006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gtf3c3-201ENSMUST00000041638 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 9530051G07Rik-201ENSMUST00000127673 4414 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 AC137842.3-201ENSMUST00000228855 2397 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Olfr1484-202ENSMUST00000208104 3621 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Olfr1484-206ENSMUST00000217451 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
Hoxd10P28359 Gm18493-201ENSMUST00000192084 1612 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms