Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Gm906-201ENSMUST00000099521 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxb4P10284 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxb4P10284 Mms19-217ENSMUST00000171561 6607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxb4P10284 1520401A03Rik-204ENSMUST00000178006 3726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Hoxb4P10284 Itk-203ENSMUST00000109237 4268 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb4P10284 Nyap2-201ENSMUST00000068275 4919 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb4P10284 Sla-201ENSMUST00000100572 2626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb4P10284 Vmn1r178-203ENSMUST00000226489 2644 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb4P10284 Zfp426-203ENSMUST00000163348 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb4P10284 Zscan18-203ENSMUST00000210650 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb4P10284 Mpzl3-203ENSMUST00000114664 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb4P10284 1700071M16Rik-203ENSMUST00000169733 2504 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb4P10284 Fam107a-203ENSMUST00000121887 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
Hoxb4P10284 E230015B07Rik-202ENSMUST00000159884 2822 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Tmc2-201ENSMUST00000077988 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Stt3a-201ENSMUST00000120381 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Arhgap17-201ENSMUST00000098060 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 C2cd3-202ENSMUST00000098259 6602 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Serbp1-201ENSMUST00000042990 15474 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Msn-201ENSMUST00000117399 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm11576-201ENSMUST00000117433 417 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm15896-201ENSMUST00000118045 440 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm12936-201ENSMUST00000121439 301 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Calr-ps-201ENSMUST00000121776 485 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm15963-201ENSMUST00000131387 876 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm11195-201ENSMUST00000135030 441 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm22523-201ENSMUST00000158696 100 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm24348-201ENSMUST00000158710 130 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Tcrg-C3-201ENSMUST00000164407 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm21060-201ENSMUST00000179346 168 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm28863-201ENSMUST00000186888 431 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm28163-201ENSMUST00000187099 325 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm5058-201ENSMUST00000187331 463 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm17954-201ENSMUST00000195893 607 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Alox5ap-203ENSMUST00000200928 356 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm2762-204ENSMUST00000201815 537 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm18453-201ENSMUST00000208000 626 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 AC109180.1-201ENSMUST00000218676 398 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 AC163357.1-201ENSMUST00000220847 233 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 AC091783.4-201ENSMUST00000224940 611 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Olfr453-201ENSMUST00000053647 954 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Snora21-201ENSMUST00000082967 137 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm23645-201ENSMUST00000083228 108 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm25682-201ENSMUST00000083942 164 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm10509-201ENSMUST00000097384 259 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 AC159809.2-202ENSMUST00000214073 3333 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Mbd5-201ENSMUST00000047413 8543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Frmpd4-201ENSMUST00000112145 7924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm3636-202ENSMUST00000163850 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Impg1-202ENSMUST00000113250 2965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 March1-201ENSMUST00000039540 2733 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm43581-201ENSMUST00000196766 2864 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Olfr1500-205ENSMUST00000216287 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Sirpb1a-203ENSMUST00000192700 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Mylk3-203ENSMUST00000122452 3036 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Erbin-202ENSMUST00000053927 6103 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Olfr1426-207ENSMUST00000220005 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Olfr295-202ENSMUST00000215365 6013 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Dmtf1-202ENSMUST00000095017 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Olfr364-ps1-201ENSMUST00000104995 1766 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Vmn1r62-201ENSMUST00000173956 1757 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Atp13a4-202ENSMUST00000057018 4054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Synb-201ENSMUST00000059362 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Bglap3-202ENSMUST00000107542 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Mccc1os-201ENSMUST00000124469 3353 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Slc12a6-201ENSMUST00000028549 6105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm14151-201ENSMUST00000109890 2672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Foxp2-204ENSMUST00000115472 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm30655-202ENSMUST00000222732 2808 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm15462-201ENSMUST00000133653 4580 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Nsrp1-201ENSMUST00000102494 3114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Ggta1-202ENSMUST00000079424 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Svs2-201ENSMUST00000044953 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Eif2ak2-201ENSMUST00000024884 4313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm10521-201ENSMUST00000097466 2574 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm43251-201ENSMUST00000198339 2712 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Wdfy4-201ENSMUST00000061753 9681 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm5384-201ENSMUST00000120313 463 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Rpl23a-ps13-201ENSMUST00000120350 441 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Fmo9-202ENSMUST00000148677 2462 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm17052-201ENSMUST00000165496 289 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm20545-201ENSMUST00000174739 210 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm22932-201ENSMUST00000175510 72 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm22420-201ENSMUST00000178795 126 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm20812-201ENSMUST00000179220 684 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm26779-201ENSMUST00000181101 551 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm26766-201ENSMUST00000181411 3677 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm21960-201ENSMUST00000181924 452 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Rps19-ps12-201ENSMUST00000181937 430 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm28017-201ENSMUST00000183434 126 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gtpbp4-ps3-201ENSMUST00000184093 136 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm29504-201ENSMUST00000185605 537 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
Hoxb4P10284 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.5 ms