Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Gm11216-201ENSMUST00000125240 354 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm13618-201ENSMUST00000128859 384 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm24113-201ENSMUST00000157477 276 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm23753-201ENSMUST00000157575 149 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm23499-201ENSMUST00000157736 268 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Scgb1b20-201ENSMUST00000166714 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm22908-201ENSMUST00000177620 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Tex50-202ENSMUST00000178511 954 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm22254-201ENSMUST00000179186 110 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm21425-201ENSMUST00000180318 699 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm7497-201ENSMUST00000183064 1003 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm29215-202ENSMUST00000188659 621 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm29428-201ENSMUST00000190086 409 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm28902-201ENSMUST00000191531 215 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm37543-201ENSMUST00000192443 1031 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm35070-201ENSMUST00000192589 621 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm30686-202ENSMUST00000195371 621 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm43649-201ENSMUST00000196596 391 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm42695-201ENSMUST00000199445 818 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm40323-201ENSMUST00000200649 645 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 4930500F04Rik-202ENSMUST00000202156 251 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 AC138284.5-201ENSMUST00000214389 652 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 AC122317.1-201ENSMUST00000218404 708 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm7045-201ENSMUST00000221466 605 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 AC154838.2-201ENSMUST00000226602 747 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 AC160756.1-201ENSMUST00000227266 235 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 9230110F15Rik-201ENSMUST00000054175 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Olfr430-201ENSMUST00000055873 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Olfr808-201ENSMUST00000060636 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Olfr748-201ENSMUST00000073561 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm18180-201ENSMUST00000187562 1484 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 AC123858.1-201ENSMUST00000226948 1874 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Olfr1408-202ENSMUST00000200689 3453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Obox1-201ENSMUST00000067288 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm43374-201ENSMUST00000202498 2391 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 Senp8-201ENSMUST00000051039 3682 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
TtrP07309 AC155830.1-201ENSMUST00000220050 3836 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Prlr-202ENSMUST00000124470 9900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm42484-201ENSMUST00000196075 2104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Vmn1r36-203ENSMUST00000226728 1458 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Olfr109-203ENSMUST00000214938 5550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Olfr1137-202ENSMUST00000214209 3073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Neurod4-201ENSMUST00000061571 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Igkv14-100-201ENSMUST00000103325 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm24318-201ENSMUST00000104490 131 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm23608-201ENSMUST00000104545 128 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm14926-201ENSMUST00000120650 508 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm12708-201ENSMUST00000126143 349 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 4930451E10Rik-201ENSMUST00000130840 409 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Tarbp2-207ENSMUST00000142114 420 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm3191-201ENSMUST00000167139 346 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm7335-201ENSMUST00000172475 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Vmn1r-ps17-201ENSMUST00000175797 894 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm7656-201ENSMUST00000182468 1004 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm28654-201ENSMUST00000189801 379 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm28872-201ENSMUST00000191518 158 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm42451-201ENSMUST00000197410 244 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm18325-201ENSMUST00000203228 835 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm45733-201ENSMUST00000212988 437 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm34081-201ENSMUST00000221332 690 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Eif1-ps2-201ENSMUST00000221990 339 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Olfr873-201ENSMUST00000053919 1062 ntAPPRIS P2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Krtap31-2-201ENSMUST00000058761 935 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Olfr699-201ENSMUST00000065024 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Olfr944-201ENSMUST00000079650 936 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Spink12-201ENSMUST00000081271 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 n-R5s7-201ENSMUST00000083755 121 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Macf1-206ENSMUST00000106224 23402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm37792-201ENSMUST00000195761 3413 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Jrkl-201ENSMUST00000110582 3223 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm15261-201ENSMUST00000136779 2763 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm13230-201ENSMUST00000120870 1575 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Vmn2r-ps49-201ENSMUST00000173160 3551 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Zfp992-201ENSMUST00000105733 4550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Zfp931-201ENSMUST00000108923 1372 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm44689-201ENSMUST00000208786 1372 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm45848-201ENSMUST00000212932 1871 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Skint10-201ENSMUST00000060327 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm2042-207ENSMUST00000181326 2440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm37668-201ENSMUST00000193745 1944 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
TtrP07309 Vmn1r30-205ENSMUST00000228635 1776 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TtrP07309 Tex47-203ENSMUST00000160634 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TtrP07309 Muc15-202ENSMUST00000111016 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
TtrP07309 Olfr677-202ENSMUST00000213204 3227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
TtrP07309 Gm2093-201ENSMUST00000180518 3526 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms