Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 AC154510.1-201ENSMUST00000223925 737 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr803-201ENSMUST00000056736 927 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr488-201ENSMUST00000072968 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr1369-ps1-201ENSMUST00000079050 954 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr1145-201ENSMUST00000079711 945 ntAPPRIS ALT2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr1145-202ENSMUST00000090707 978 ntAPPRIS P2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Erbin-207ENSMUST00000191275 5552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Zfp990-201ENSMUST00000105741 3044 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr388-ps1-201ENSMUST00000118336 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 AC134860.3-201ENSMUST00000223564 1300 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr598-202ENSMUST00000214765 2026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm43200-201ENSMUST00000200385 2161 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Vmn1r185-213ENSMUST00000228676 5199 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Fap-202ENSMUST00000102732 2751 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Sorbs2-203ENSMUST00000124544 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm3616-201ENSMUST00000174430 2514 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm3683-201ENSMUST00000175701 2513 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Rian-201ENSMUST00000180876 8089 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Olfr577-202ENSMUST00000214080 3282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 Gm15518-201ENSMUST00000127115 2108 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 P2ry10-201ENSMUST00000053375 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
Ccl20O89093 BC117090-201ENSMUST00000114850 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm11566-201ENSMUST00000118550 203 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm5943-201ENSMUST00000119458 459 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm12466-201ENSMUST00000121199 620 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm23171-201ENSMUST00000157159 264 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm24014-201ENSMUST00000157728 157 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm17546-201ENSMUST00000168960 733 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Svs4-201ENSMUST00000017142 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Mir6903-201ENSMUST00000183597 88 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm27414-201ENSMUST00000185033 381 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm28859-201ENSMUST00000186650 616 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm28967-201ENSMUST00000187351 281 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 4930433B08Rik-201ENSMUST00000192010 644 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm37878-201ENSMUST00000192108 387 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm4248-201ENSMUST00000196905 316 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm42502-201ENSMUST00000198550 1089 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm45604-201ENSMUST00000209665 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm45689-201ENSMUST00000210522 133 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm30606-201ENSMUST00000212801 847 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm4928-201ENSMUST00000219622 850 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC105407.3-201ENSMUST00000224161 648 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Defa34-201ENSMUST00000075268 375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm23518-201ENSMUST00000082835 153 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Vmn1r43-201ENSMUST00000089418 1069 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Defa5-201ENSMUST00000098892 376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr1111-201ENSMUST00000099860 940 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr1037-201ENSMUST00000099911 1125 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr986-202ENSMUST00000214763 3274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Cfap97-206ENSMUST00000164504 4521 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Pramel6-202ENSMUST00000111572 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Vmn1r47-202ENSMUST00000227229 6733 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Vmn1r47-204ENSMUST00000228680 6717 ntAPPRIS P1 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Csnka2ip-201ENSMUST00000089279 1336 ntAPPRIS P2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Slc9c1-201ENSMUST00000159945 3836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm44678-201ENSMUST00000207828 2775 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm3696-201ENSMUST00000167923 1814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm5590-202ENSMUST00000186976 2315 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Olfr1471-205ENSMUST00000217482 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Vmn1r18-202ENSMUST00000228574 14315 ntAPPRIS P1 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm45264-201ENSMUST00000210090 3995 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm37862-201ENSMUST00000193079 2533 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm43751-201ENSMUST00000200275 3071 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 AC126033.1-201ENSMUST00000227628 6773 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Vmn1r45-205ENSMUST00000227571 2757 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 4932415D10Rik-202ENSMUST00000217661 15111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 4930522H14Rik-202ENSMUST00000102725 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm26387-201ENSMUST00000104238 132 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm26143-201ENSMUST00000104480 108 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm11905-201ENSMUST00000117653 678 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm15364-201ENSMUST00000119618 585 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm13737-201ENSMUST00000119793 232 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Vmn1r-ps107-201ENSMUST00000121458 581 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm11385-201ENSMUST00000121513 570 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm11931-201ENSMUST00000121630 447 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm5392-201ENSMUST00000122189 789 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm14435-202ENSMUST00000127687 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Rap1gapos-201ENSMUST00000135358 471 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm15340-201ENSMUST00000144984 704 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm12204-201ENSMUST00000147412 333 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm12278-201ENSMUST00000153718 407 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm24444-201ENSMUST00000157244 308 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm2862-201ENSMUST00000161524 328 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
Ccl20O89093 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
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