Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Angel2-201ENSMUST00000027947 3562 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Zfp606-205ENSMUST00000209403 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 AW551984-202ENSMUST00000119722 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm35066-201ENSMUST00000198898 2074 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.11□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm43175-201ENSMUST00000198450 3810 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Ppm1k-201ENSMUST00000042766 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Il12rb2-202ENSMUST00000117441 2600 ntTSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 AC162910.1-201ENSMUST00000221219 1723 ntBASIC6.11□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Zfp763-201ENSMUST00000087654 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.11□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm4070-202ENSMUST00000176467 9007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gvin1-202ENSMUST00000183409 9005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Fat1-203ENSMUST00000189017 14651 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Dpp10-202ENSMUST00000112606 15297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm42661-201ENSMUST00000202364 1442 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm42561-201ENSMUST00000202563 1442 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 4930444F02Rik-201ENSMUST00000215429 6871 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Ccnb2-ps-201ENSMUST00000118290 623 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm11447-201ENSMUST00000118983 858 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm14874-201ENSMUST00000118995 438 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm12607-201ENSMUST00000120724 493 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm11894-201ENSMUST00000121579 328 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm14330-201ENSMUST00000155455 455 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm13773-201ENSMUST00000156693 583 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm17511-201ENSMUST00000172206 342 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Olfr753-ps1-202ENSMUST00000174673 919 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm23806-201ENSMUST00000175157 109 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm20794-201ENSMUST00000177626 628 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 AV026068-202ENSMUST00000185793 486 ntTSL 2 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Tardbp-223ENSMUST00000189048 1096 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm37996-201ENSMUST00000191859 367 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm36891-201ENSMUST00000191995 655 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm38234-201ENSMUST00000195204 421 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 4930539C22Rik-201ENSMUST00000198231 970 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm9332-201ENSMUST00000198431 730 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm45556-201ENSMUST00000210689 345 ntTSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm7607-201ENSMUST00000214920 518 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 AC101677.1-201ENSMUST00000218590 158 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 AC155634.2-201ENSMUST00000222001 489 ntTSL 3 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 AV026068-231ENSMUST00000225862 482 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 1700030N03Rik-203ENSMUST00000190575 3146 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Tdrd12-204ENSMUST00000193633 3651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm37903-201ENSMUST00000192122 2381 ntBASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Adgb-205ENSMUST00000179956 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm28940-201ENSMUST00000187929 1682 ntTSL 1 (best) BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Olfr1037-202ENSMUST00000213333 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Ktn1-221ENSMUST00000190535 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.1□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Olfr1487-204ENSMUST00000216688 2038 ntTSL 5 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm13712-201ENSMUST00000117484 2295 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Ubtfl1-203ENSMUST00000169398 4430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Vmn2r-ps117-201ENSMUST00000176899 2188 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm24265-201ENSMUST00000101833 141 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm23750-201ENSMUST00000104222 132 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Arhgdib-202ENSMUST00000111891 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm14987-201ENSMUST00000117820 676 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm15113-201ENSMUST00000119280 836 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm14046-201ENSMUST00000119389 509 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm12074-201ENSMUST00000120189 219 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm14302-201ENSMUST00000122806 382 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm15243-201ENSMUST00000151101 382 ntTSL 2 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm13062-201ENSMUST00000151337 562 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm24901-201ENSMUST00000158125 110 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Mir1963-201ENSMUST00000158594 59 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Mir5103-201ENSMUST00000175111 79 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm22122-201ENSMUST00000175147 200 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm20673-201ENSMUST00000177167 430 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Obox3-ps2-201ENSMUST00000177243 1004 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm24407-201ENSMUST00000177864 141 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm22911-201ENSMUST00000177920 107 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm27148-201ENSMUST00000185086 160 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm28429-201ENSMUST00000188521 363 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm37173-201ENSMUST00000194498 1017 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm37418-201ENSMUST00000195031 274 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm44431-201ENSMUST00000203500 413 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm45494-201ENSMUST00000211167 545 ntTSL 3 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm45870-201ENSMUST00000211269 601 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gm45814-201ENSMUST00000212646 775 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 4930556N09Rik-202ENSMUST00000219466 1015 ntTSL 1 (best) BASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 AC154452.1-201ENSMUST00000225819 241 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Spocd1B1ASB6 AC117588.2-201ENSMUST00000228340 311 ntBASIC6.09□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77 ms