Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Il3-201ENSMUST00000019058 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm38201-201ENSMUST00000192143 387 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm8823-201ENSMUST00000193158 433 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm38172-201ENSMUST00000195321 567 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AI506816-203ENSMUST00000198461 503 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm17951-201ENSMUST00000198536 496 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Trav7-5-201ENSMUST00000200609 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm44006-201ENSMUST00000204273 396 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm44523-201ENSMUST00000205616 417 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm44779-201ENSMUST00000206937 708 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm45659-201ENSMUST00000209295 564 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC163664.1-201ENSMUST00000226251 1248 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC167013.2-202ENSMUST00000227035 333 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC121542.1-201ENSMUST00000227245 721 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr675-201ENSMUST00000073102 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Snord22-201ENSMUST00000083153 126 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr606-201ENSMUST00000098200 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Vps13d-202ENSMUST00000036579 15849 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr1242-204ENSMUST00000216001 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Cd86-201ENSMUST00000089620 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm37345-201ENSMUST00000193062 3138 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm28710-202ENSMUST00000211738 2987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr1016-203ENSMUST00000217410 2738 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm19619-201ENSMUST00000200707 3201 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm38374-201ENSMUST00000194417 2033 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC149294.7-201ENSMUST00000227475 1432 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr32-204ENSMUST00000215153 3117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC154552.6-201ENSMUST00000221365 1342 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Cd226-201ENSMUST00000037142 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Bpifc-202ENSMUST00000105304 451 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm3086-201ENSMUST00000110560 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm13755-201ENSMUST00000118509 305 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm12090-201ENSMUST00000118692 758 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm12448-201ENSMUST00000118852 655 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm13080-201ENSMUST00000120556 420 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm13502-201ENSMUST00000121574 684 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Klra17-202ENSMUST00000122219 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm13348-201ENSMUST00000147324 690 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm22601-201ENSMUST00000157595 250 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm25264-201ENSMUST00000158519 117 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm16055-201ENSMUST00000161366 626 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm20663-201ENSMUST00000176647 474 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm25525-201ENSMUST00000177701 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm26178-201ENSMUST00000177706 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm26465-201ENSMUST00000178517 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm20795-201ENSMUST00000178528 699 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm24317-201ENSMUST00000178536 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm25021-201ENSMUST00000179184 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm22995-201ENSMUST00000179670 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm24424-201ENSMUST00000179714 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm24389-201ENSMUST00000179962 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm25672-201ENSMUST00000180111 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm29163-201ENSMUST00000188029 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm35570-201ENSMUST00000198730 681 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm18452-201ENSMUST00000202968 1111 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm43941-201ENSMUST00000203303 1073 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC127302.1-201ENSMUST00000215973 1111 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 RMST_1.1-204ENSMUST00000217871 699 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC118006.2-201ENSMUST00000224167 962 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC147639.1-201ENSMUST00000224216 661 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 AC141884.1-201ENSMUST00000226327 636 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 CT573086.3-201ENSMUST00000228762 594 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr1029-201ENSMUST00000082191 1061 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm23815-201ENSMUST00000083231 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr1278-201ENSMUST00000090330 942 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm23520-201ENSMUST00000093736 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Vmn1r42-202ENSMUST00000226436 4045 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Ak9-201ENSMUST00000173494 6968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Cfap54-207ENSMUST00000168110 9903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm43668-201ENSMUST00000197014 5342 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Fbxw28-204ENSMUST00000200156 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm2123-201ENSMUST00000221476 2836 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Olfr575-202ENSMUST00000213477 3512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 4930503E14Rik-201ENSMUST00000100688 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Igkv6-32-201ENSMUST00000103377 366 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Vmn1r-ps108-201ENSMUST00000117059 365 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm12379-201ENSMUST00000119607 391 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm9435-201ENSMUST00000120379 877 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm8051-201ENSMUST00000120464 466 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm12998-201ENSMUST00000122445 789 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm25713-201ENSMUST00000158625 109 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Iltifb-201ENSMUST00000163808 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Taf1d-202ENSMUST00000164079 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Obox2-202ENSMUST00000172478 818 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm18397-201ENSMUST00000176704 587 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm8221-201ENSMUST00000178052 564 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Mir3473f-201ENSMUST00000183743 136 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Cox6b2-208ENSMUST00000183971 401 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm27427-201ENSMUST00000185134 193 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 A930005H10Rik-202ENSMUST00000185424 433 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 1700020G17Rik-202ENSMUST00000190237 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm37599-201ENSMUST00000193067 489 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
Grik3B1AS29 Gm38108-201ENSMUST00000193891 399 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 99.7 ms