Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lrit3W8DXL4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lrit3W8DXL4 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms