Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm3550W4VSN7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Gm3550W4VSN7 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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