Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

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Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Csmd2V9GX34 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Csmd2V9GX34 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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