Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Vstm4T1NXB5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Vstm4T1NXB5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms