Protein–RNA interactions for Protein: S4R181

Ccdc166, Coiled-coil domain-containing 166, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc166S4R181 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc166S4R181 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms