Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Y3

Homer1, Homer protein homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer1Q9Z2Y3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Homer1Q9Z2Y3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms