Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip6Q9Z1Y4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip6Q9Z1Y4 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms