Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Ddx39bQ9Z1N5 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Ddx39bQ9Z1N5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms