Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1J2

Nek4, Serine/threonine-protein kinase Nek4, mousemouse

Predictions only

Length 792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek4Q9Z1J2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Nek4Q9Z1J2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nek4Q9Z1J2 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms