Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NfkbiaQ9Z1E3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NfkbiaQ9Z1E3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms