Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne6Q9Z140 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne6Q9Z140 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms