Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z131

Sh3bp5, SH3 domain-binding protein 5, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5Q9Z131 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Sh3bp5Q9Z131 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sh3bp5Q9Z131 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Sh3bp5Q9Z131 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.4 ms