Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cldn13Q9Z0S4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms