Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVF7

Pole, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 2,283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PoleQ9WVF7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PoleQ9WVF7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PoleQ9WVF7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PoleQ9WVF7 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PoleQ9WVF7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.3 ms