Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVD4

Clcn5, H(+)/Cl(-) exchange transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 746 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn5Q9WVD4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Clcn5Q9WVD4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms