Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP1

Ramp3, Receptor activity-modifying protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ramp3Q9WUP1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ramp3Q9WUP1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ramp3Q9WUP1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms