Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkraQ9WTX2 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkraQ9WTX2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkraQ9WTX2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkraQ9WTX2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkraQ9WTX2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkraQ9WTX2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkraQ9WTX2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkraQ9WTX2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkraQ9WTX2 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PrkraQ9WTX2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
PrkraQ9WTX2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms