Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTV6

Usp18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp18Q9WTV6 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Usp18Q9WTV6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp18Q9WTV6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Usp18Q9WTV6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Usp18Q9WTV6 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Usp18Q9WTV6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Usp18Q9WTV6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Usp18Q9WTV6 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp18Q9WTV6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp18Q9WTV6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp18Q9WTV6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp18Q9WTV6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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