Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q3

Tmed2, Transmembrane emp24 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed2Q9R0Q3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Tmed2Q9R0Q3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms