Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0M3

Srpx, Sushi-repeat-containing protein SRPX, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpxQ9R0M3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SrpxQ9R0M3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SrpxQ9R0M3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms