Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G8

Nrk, Nik-related protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrkQ9R0G8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NrkQ9R0G8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NrkQ9R0G8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NrkQ9R0G8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms