Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0E1

Plod3, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plod3Q9R0E1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Plod3Q9R0E1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Plod3Q9R0E1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms