Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Wdr54Q9R0D8 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Wdr54Q9R0D8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms