Protein–RNA interactions for Protein: Q9R061

Nubp2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nubp2Q9R061 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nubp2Q9R061 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nubp2Q9R061 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms