Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Clcf1Q9QZM3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Clcf1Q9QZM3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms